Wydział Chemii prowadzi bardzo szeroką tematykę badawczą w zakresie projektowania, syntezy i oczyszczania różnorodnych związków chemicznych oraz badania aktywności biologicznej większości z nich, obliczeń głównie w zakresie foldingu peptydów i białek metodą pola siłowego UNRES, uszkodzeń DNA za pomocą niskoenergetycznych elektronów wtórnych i badań strukturalnych związków i energetycznych sieci krystalicznej metodą dyfraktometryczną. Najważniejsze grupy tematów badawczych realizowanych na Wydziale ujęto w punktach: