Prace doktorskie wykonywane obecnie w Zespole Symulacji Polimerów:

1. Badanie oddziaływań hydrofobowych i lokalnych w modelowych układach oraz białkach, Karolina Zięba, promotor: prof. dr hab. Cezary Czaplewski, promotor pomocniczy dr Magdalena Ślusarz
2. Zastosowanie algorytmów genetycznych do optymalizacji parametrów pola siłowego UNRES, Dawid Jagieła, promotor: prof. dr hab. Cezary Czaplewski
3. Przewidywanie struktur białek metodą dynamicznego składania fragmentów i zawężania przestrzeni konformacyjnej w polu siłowym UNRES, Bartłomiej Zaborowski, promotor: prof. dr hab. Cezary Czaplewski

Prace doktorskie wykonane w Pracowni Symulacji Polimerów:

1. Przewidywanie struktury kompleksów białek przy użyciu gruboziarnistego pola siłowego UNRES z wykorzystaniem informacji z baz danych, Agnieszka Karczyńska, 2019, promotor: dr hab. Cezary Czaplewski, promotor pomocniczy dr Paweł Krupa
2. Algorytmy dynamiki molekularnej i Monte Carlo oraz ich rozszerzenia w gruboziarnistych symulacjach zwijania polipeptydów, Tomasz Wirecki, 2016, promotor: dr hab. Cezary Czaplewski, promotor pomocniczy dr Artur Giełdoń
3. Rozszerzenie pola siłowego UNRES o potencjały lokalne i dane z metod porównawczych w celu lepszego przewidywania struktur białek, Paweł Krupa, 2015, promotor: dr hab. Cezary Czaplewski, promotor pomocniczy dr Adam Sieradzan